Jira (작년까지 Asana 사용했었습니다.)
Confluence (별도 Wiki 운영하고 있었는데 요즘에 개발관련 이슈나 내용은 이쪽으로 정리하고 있습니다. Jira랑 연동이 잘 되니...)
Jenkins (빌드 + 패키징) Windows, OSX, Linux(Ubuntu 12.04, 14.04)를 지원해야 해서 구축해 놨습니다.
Git, GitHub (사내에서 SVN 에서 Git으로 넘어가고 있습니다.)
Bugzilla (예전에 Mantis가 더 쓰기 편했던 것 같은데... 개인적으로 좀 불편하네요.)
TestTrail (QA에서 쓰고 있는 건데 테스트를 아주 세세하게 만들어 놔서 담당자가 바뀌어도 크게 지장이 없을 것 같네요. 제가 쓰는 건 아니지만 좋아 보입니다.)